46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0121 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  100 
 
 		 407 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.11 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  23.94 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.67 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  19.66 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  20.63 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.27 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.08 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  28.32 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  21.92 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  26.09 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.09 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  22.16 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  22.17 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.24 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.68 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  21.91 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  21.01 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  19.86 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  32.89 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.44 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  36.05 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  34.85 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  22.17 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  21.62 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  19.3 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  20.66 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  21.08 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  20.15 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  31.9 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  20.15 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.04 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  19.4 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.97 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  20.1 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  20.45 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  20.65 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  34.43 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  45.65 
 
 		 584 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  44.44 
 
 		 565 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  28.89 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  23.4 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  38.24 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>