More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1310 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 351 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  29.92 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 		 871 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  41.73 
 
 		 819 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 816 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 812 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 810 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  39.29 
 
 		 803 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.84 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  26.49 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 772 aa  86.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  37.41 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  35.83 
 
 		 816 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  35.17 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  33.12 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.52 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  24.92 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  36.88 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.14 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  35.07 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  36.67 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  36.88 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  40.17 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.33 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  40.17 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  35.07 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  35.81 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  39.39 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  41.74 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  28.86 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  47.92 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  41.74 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  35.14 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>