More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  82.91 
 
 		 610 aa  947    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  82.54 
 
 		 610 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  80.37 
 
 		 608 aa  899    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  84.41 
 
 		 593 aa  957    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  80.84 
 
 		 608 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  80.64 
 
 		 605 aa  933    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  82.91 
 
 		 610 aa  947    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  97.15 
 
 		 596 aa  1086    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  100 
 
 		 596 aa  1179    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  82.54 
 
 		 610 aa  925    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  82.35 
 
 		 595 aa  915    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  58.06 
 
 		 588 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 		 597 aa  618  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  52.4 
 
 		 621 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  52.27 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 		 589 aa  445  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.36 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.91 
 
 		 587 aa  263  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.48 
 
 		 582 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.87 
 
 		 572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.59 
 
 		 587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.59 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.59 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.32 
 
 		 594 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.59 
 
 		 571 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.59 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.59 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.59 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 598 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.46 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  32.96 
 
 		 575 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.9 
 
 		 587 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.24 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.24 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.24 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.24 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.42 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 632 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  29.96 
 
 		 578 aa  246  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.88 
 
 		 579 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 		 619 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.83 
 
 		 576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.11 
 
 		 594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.02 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31 
 
 		 597 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  33.73 
 
 		 578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  30.35 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.08 
 
 		 587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.4 
 
 		 584 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.82 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.92 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.75 
 
 		 585 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.92 
 
 		 609 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.86 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.51 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.23 
 
 		 627 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.98 
 
 		 594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.79 
 
 		 628 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  30.18 
 
 		 573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  33.14 
 
 		 586 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  32.11 
 
 		 640 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.43 
 
 		 622 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  29.46 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.75 
 
 		 596 aa  240  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  33.53 
 
 		 627 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  26.76 
 
 		 607 aa  239  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.35 
 
 		 598 aa  239  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.13 
 
 		 582 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  31.82 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.7 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.16 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.69 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.7 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  33.03 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  30.87 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.1 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.16 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.73 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.16 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.16 
 
 		 593 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.34 
 
 		 600 aa  238  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  30.82 
 
 		 627 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  30.82 
 
 		 627 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.07 
 
 		 768 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.61 
 
 		 590 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.08 
 
 		 614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>