142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  59.01 
 
 
376 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  58.56 
 
 
374 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  60 
 
 
376 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  55.86 
 
 
357 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.51 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  46.59 
 
 
343 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  41.22 
 
 
245 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  41.22 
 
 
245 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  41.22 
 
 
245 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.64 
 
 
235 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.8 
 
 
372 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.8 
 
 
372 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  44.64 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  41.22 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  44.04 
 
 
372 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  39.32 
 
 
232 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  44.16 
 
 
237 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.63 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  41.63 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.2 
 
 
235 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.86 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  44.13 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.53 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  43.56 
 
 
270 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  39.57 
 
 
387 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.6 
 
 
233 aa  125  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.82 
 
 
242 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.95 
 
 
396 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  39.73 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  33.94 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  36.99 
 
 
242 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  43.67 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  40.81 
 
 
231 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  44.13 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  32.31 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  41.55 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  38.49 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  40.93 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.91 
 
 
246 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  39.21 
 
 
365 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.8 
 
 
231 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  35.94 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  38.79 
 
 
235 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.29 
 
 
401 aa  109  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  35.86 
 
 
376 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  32.11 
 
 
227 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  34.86 
 
 
233 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  40.95 
 
 
231 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  41.03 
 
 
233 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.6 
 
 
241 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.44 
 
 
236 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  41.06 
 
 
231 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.93 
 
 
234 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  39.82 
 
 
383 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  39.92 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  38.91 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.6 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  39.66 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.47 
 
 
231 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.74 
 
 
240 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.53 
 
 
232 aa  98.6  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  37.84 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  42.24 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.18 
 
 
399 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.74 
 
 
360 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  34.15 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  38.64 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.85 
 
 
227 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  31 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  37.21 
 
 
231 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  37.67 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  35.9 
 
 
235 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  40.28 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  38.07 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  28.64 
 
 
226 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.66 
 
 
389 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  37.95 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  37.1 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  43.75 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.64 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  29.91 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  38.64 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  29.11 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  41.1 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  29.44 
 
 
229 aa  89  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  28.9 
 
 
226 aa  87  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  28.9 
 
 
226 aa  87  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  29.11 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  27.39 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  31.49 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1260  nodulin-lile protein  91.84 
 
 
50 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.714692  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.73 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  24.77 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  23.91 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>