46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01251 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  988    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 
1400 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.29 
 
 
1217 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.02 
 
 
4334 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0112  hypothetical protein  29.05 
 
 
677 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0954339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.01 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  28.94 
 
 
623 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  27.81 
 
 
1880 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 
965 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.8 
 
 
1363 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  27.19 
 
 
1895 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  28.21 
 
 
1787 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  31.52 
 
 
1572 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.32 
 
 
1279 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  27.44 
 
 
946 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  30.03 
 
 
742 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  36.21 
 
 
610 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.41 
 
 
1421 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.87 
 
 
2667 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  28.76 
 
 
942 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.73 
 
 
491 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.17 
 
 
860 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  26.68 
 
 
4800 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  29.6 
 
 
728 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  28.42 
 
 
595 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  27.22 
 
 
518 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  30.68 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  28.12 
 
 
739 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 
1864 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  34.52 
 
 
606 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.18 
 
 
1079 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 
3954 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  28.61 
 
 
1287 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 
1855 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3277  hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 
371 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  26.34 
 
 
795 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.52 
 
 
820 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  30.36 
 
 
982 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  27.14 
 
 
1814 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  27.59 
 
 
959 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  26.56 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  28.06 
 
 
526 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  30.23 
 
 
232 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  27.87 
 
 
14829 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0797  hypothetical protein  30.81 
 
 
300 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>