101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18001 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  98.77 
 
 
99 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18171  photosystem I subunit VII  100 
 
 
81 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.102176  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17951  photosystem I subunit VII  100 
 
 
81 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.028019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18001  photosystem I subunit VII  100 
 
 
81 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  98.77 
 
 
91 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  98.77 
 
 
81 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  97.53 
 
 
81 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  97.53 
 
 
81 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  97.53 
 
 
81 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0454  photosystem I subunit VII  93.83 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  95.06 
 
 
81 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  92.59 
 
 
81 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  92.59 
 
 
81 aa  158  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.71 
 
 
327 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
840 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  38.6 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
369 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  35.59 
 
 
540 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.66 
 
 
316 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.33 
 
 
509 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  42.86 
 
 
507 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.73 
 
 
404 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  41.51 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  37.7 
 
 
500 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  39.34 
 
 
500 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.9 
 
 
540 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  39.34 
 
 
500 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  42.59 
 
 
275 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.09 
 
 
310 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  43.33 
 
 
277 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.7 
 
 
500 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
509 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.67 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 
634 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  40.68 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  39.62 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09770  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase, homodimeric  37.18 
 
 
1183 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 
431 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
378 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.86 
 
 
331 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.72 
 
 
400 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00640  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  37.29 
 
 
62 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000382755  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 
427 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 
987 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  35.59 
 
 
509 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.82 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.62 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  37.74 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.98 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
394 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1052  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  38.1 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0602855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4865  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32.86 
 
 
1191 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4954  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 
1191 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  33.33 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.18 
 
 
979 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 
979 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.18 
 
 
979 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
589 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.34 
 
 
397 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00580  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  37.29 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00222598  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2143  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.77 
 
 
1180 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.955322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  33.9 
 
 
213 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.9 
 
 
213 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
421 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2321  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157203  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 
987 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  33.93 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  32.79 
 
 
259 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  38.24 
 
 
307 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2326  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000130298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  32.79 
 
 
259 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 
393 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  34.48 
 
 
501 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  34.48 
 
 
64 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.43 
 
 
423 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 
870 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  36.84 
 
 
190 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>