More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_17071 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_17071  site-specific recombinase  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17191  site-specific recombinase  91.79 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1607  site-specific recombinase  86.83 
 
 		 224 aa  352  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138506  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16951  site-specific recombinase  71.22 
 
 		 240 aa  297  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.378024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  44.68 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  44.15 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  30.6 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  31.28 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.79 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.22 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  30.94 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  29.78 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22571  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  27.27 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  27.27 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  29.61 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  28.88 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.79 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  26.97 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  28.57 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  25.97 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  30.53 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.41 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  29.55 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  27.17 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  30.2 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  27.17 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  27.22 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  28.18 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  27.62 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.53 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  30.38 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  26.88 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  28.04 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  28.34 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  27.62 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  25.27 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  25.56 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  25.56 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  27.33 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.1 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  29.57 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  28.48 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  25.97 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.07 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  31.08 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  29.95 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  25 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  29.93 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  27.37 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  23.89 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  27.37 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  28.38 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  29.61 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  28.76 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  28.38 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  32.48 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  27.27 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  25.82 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  29.05 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  27.37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  27.81 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.07 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  27.95 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  27.95 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  26.52 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  27.95 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>