More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_03261 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  94.74 
 
 
723 aa  1399    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  100 
 
 
723 aa  1465    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  68.52 
 
 
722 aa  1027    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  95.44 
 
 
723 aa  1410    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  39.34 
 
 
727 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  36.38 
 
 
730 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  39.07 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  38.68 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  37.01 
 
 
675 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  36.99 
 
 
675 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  26.17 
 
 
796 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  25.1 
 
 
709 aa  207  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  24.9 
 
 
720 aa  200  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  29.12 
 
 
767 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  23.52 
 
 
717 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  25.85 
 
 
765 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  24.39 
 
 
791 aa  130  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.59 
 
 
386 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.74 
 
 
386 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.46 
 
 
379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.8 
 
 
379 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  25.45 
 
 
327 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.06 
 
 
372 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  25.96 
 
 
314 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.71 
 
 
374 aa  97.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  26.2 
 
 
349 aa  97.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  27.4 
 
 
340 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  24.79 
 
 
358 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  28.23 
 
 
348 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  25.27 
 
 
354 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  25.16 
 
 
325 aa  94.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  25.62 
 
 
355 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  24.62 
 
 
309 aa  94  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  24.79 
 
 
352 aa  93.6  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.97 
 
 
358 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  26.72 
 
 
337 aa  93.2  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  26.32 
 
 
317 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  27.39 
 
 
317 aa  93.2  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
364 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  26.11 
 
 
351 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  25.43 
 
 
326 aa  92  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  24.52 
 
 
355 aa  91.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  26.76 
 
 
291 aa  91.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  24.76 
 
 
351 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  26.1 
 
 
323 aa  90.9  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  23.45 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.85 
 
 
366 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  26.54 
 
 
347 aa  87  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  27.54 
 
 
378 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  25.15 
 
 
316 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.43 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  25.63 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  22.55 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  25.44 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  25.21 
 
 
360 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  24.86 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  27.78 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1751  selenophosphate synthetase  25.65 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  27.76 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  22.96 
 
 
321 aa  84  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.87 
 
 
369 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  24.64 
 
 
354 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
346 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  22.74 
 
 
402 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  27.4 
 
 
348 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.8 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0711  selenophosphate synthetase  24.44 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  26.77 
 
 
342 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0151  selenophosphate synthetase  25.1 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.270141  normal  0.0151469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  25.59 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  24.16 
 
 
357 aa  82  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  23.67 
 
 
380 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  23.9 
 
 
348 aa  82  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  23.48 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  25.21 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  24.78 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  25.07 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  23.93 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  25.07 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  24.34 
 
 
347 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  25.33 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  25.33 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  25.33 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  25.33 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  24.65 
 
 
347 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  24.34 
 
 
347 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.39 
 
 
374 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  25.33 
 
 
347 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  22.25 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  24.33 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.97 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  25.33 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.24 
 
 
356 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  24.58 
 
 
352 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
354 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  25.28 
 
 
357 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
357 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  26.07 
 
 
343 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
357 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0017  selenophosphate synthetase  25.71 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>