More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04121 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 		 391 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  62.21 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  60.21 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  59.95 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  59.59 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  58.07 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  46.39 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  46.13 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  45.48 
 
 		 391 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  45.48 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  42.01 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  38.87 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  38.5 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.72 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.99 
 
 		 374 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.92 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.8 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  24.44 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  25.37 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.14 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.45 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.28 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  24.03 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.7 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  24.2 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.61 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  23.73 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.88 
 
 		 896 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.21 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  25.68 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  24.94 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  31.76 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  23.75 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  27.17 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  25.64 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  28.22 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.96 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.16 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  24.01 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.28 
 
 		 662 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  24.63 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  31.45 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.21 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  23.38 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  23.9 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.65 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.58 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  24.62 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.81 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  23.58 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  23.33 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  22.98 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  23.58 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.14 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.61 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  27.18 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  23.51 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  23.7 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.48 
 
 		 644 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.44 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.71 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  28.21 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.71 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.45 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.64 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.93 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.63 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.41 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.96 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.65 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.89 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  24.15 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.65 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  24.59 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.43 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.17 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  28.33 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  26.25 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.74 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  24.63 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  22.53 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.93 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.14 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.4 
 
 		 605 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  22.81 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  27.7 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.94 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.32 
 
 		 560 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>