More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03831 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  65.73 
 
 
145 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 
147 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 
147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
146 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  68.22 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 
166 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 
151 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 
146 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.57 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  61.24 
 
 
146 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  51.72 
 
 
146 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 
150 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  54.74 
 
 
153 aa  164  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
153 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
153 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  51.68 
 
 
172 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
145 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 
149 aa  158  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 
150 aa  158  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
144 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
144 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
148 aa  155  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
153 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 
178 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
144 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
144 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 
152 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.39 
 
 
149 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
146 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
150 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
148 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
145 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
148 aa  153  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
145 aa  153  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 
147 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
159 aa  153  8e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
156 aa  153  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
149 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
179 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
145 aa  151  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
152 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 
151 aa  151  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 
178 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  49.65 
 
 
149 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
142 aa  151  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
160 aa  151  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 
147 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
148 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
151 aa  150  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 
184 aa  150  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 
148 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
150 aa  150  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
244 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
149 aa  150  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
151 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
150 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
146 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
146 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
146 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
158 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.78 
 
 
144 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.62 
 
 
145 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
154 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 
150 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  48.98 
 
 
150 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
146 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
150 aa  147  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 
149 aa  147  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
147 aa  147  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
150 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
156 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
207 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
207 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
207 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 
150 aa  146  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.06 
 
 
145 aa  146  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
159 aa  146  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
150 aa  146  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>