More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0534 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  80.42 
 
 		 151 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  81.38 
 
 		 148 aa  244  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  80.56 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  78.87 
 
 		 149 aa  239  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  74.66 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  80.71 
 
 		 146 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  80.71 
 
 		 146 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  79.29 
 
 		 144 aa  226  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  80 
 
 		 146 aa  226  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  80 
 
 		 146 aa  226  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  77.46 
 
 		 146 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  77.3 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  77.3 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  77.3 
 
 		 144 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  73.29 
 
 		 179 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  73.29 
 
 		 149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  71.92 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  70.55 
 
 		 149 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3285  3-dehydroquinate dehydratase  78.57 
 
 		 151 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  66.2 
 
 		 161 aa  196  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  69.57 
 
 		 146 aa  193  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.13 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  65.97 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.9 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.63 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  64.63 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 150 aa  189  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  65.49 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  63.45 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 148 aa  185  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 		 148 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0245  3-dehydroquinate dehydratase  63.85 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 207 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 207 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0255  3-dehydroquinate dehydratase  63.85 
 
 		 150 aa  176  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 207 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1203  3-dehydroquinate dehydratase  65.38 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.802728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0393  3-dehydroquinate dehydratase  65.38 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0460  3-dehydroquinate dehydratase  65.38 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  61.18 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3840  3-dehydroquinate dehydratase  62.31 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0684157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4416  3-dehydroquinate dehydratase  65.35 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0161291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 244 aa  170  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3682  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.31 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  65 
 
 		 167 aa  169  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 150 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 150 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 162 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  56.46 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  59.12 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  59.59 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 172 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.66 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  53.06 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 178 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0370  3-dehydroquinate dehydratase  64.52 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 193 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>