More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0941 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  93.26 
 
 		 178 aa  344  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  68.35 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  63.89 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 144 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 144 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 146 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 150 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 150 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  60.54 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 151 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 154 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 150 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  57.96 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 155 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.14 
 
 		 149 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 150 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  56.86 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 151 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  56.86 
 
 		 207 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  56.86 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 		 141 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 146 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 151 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.86 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  56.96 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.33 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.5 
 
 		 148 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 156 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  59.46 
 
 		 151 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.06 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 151 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.43 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 148 aa  161  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  53.64 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  60.99 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  58.16 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  56.49 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  58.11 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 147 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  55.7 
 
 		 151 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 150 aa  158  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.04 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 148 aa  157  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 147 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 150 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.61 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 145 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 152 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 145 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 149 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 		 148 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 148 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 144 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 147 aa  150  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 148 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50.3 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>