More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1833 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  296  7e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  77.08 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  75.19 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 166 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.69 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  57.14 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.86 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  61.72 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 		 150 aa  164  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.39 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 179 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 146 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.93 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  57.45 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.94 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.03 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62322  3-dehydroquinate dehydratase 1 (3-dehydroquinase 1) (Type II DHQase 1)  55.15 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 244 aa  153  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 207 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 207 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>