More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3322 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 327 aa  621  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  41.48 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  39.22 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.8 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  40.13 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.48 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.29 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.18 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  38.62 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.84 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  39.01 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.83 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.25 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 		 835 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  39.25 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.02 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.01 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  37.16 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.52 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.92 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.36 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.99 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  38.66 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  39.2 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.07 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.2 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.95 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.91 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39.82 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.79 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.34 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.03 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  38.25 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.71 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.71 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>