More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2688 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 408 aa  836    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  68.29 
 
 		 406 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 		 396 aa  534  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 414 aa  519  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  67.2 
 
 		 408 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  60.05 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  62.6 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  63.12 
 
 		 411 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.7 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 422 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  61.23 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  60.74 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 409 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 408 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 401 aa  504  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.95 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  59.71 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  62.12 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 420 aa  501  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 404 aa  501  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  60.46 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  61.25 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  61.87 
 
 		 413 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  63.28 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  61.56 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  60.66 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  59.31 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  60.66 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.05 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>