More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2130 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2130  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
324 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  40 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.2 
 
 
272 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.61 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  31.2 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
273 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 
255 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  30.16 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  30.08 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  32.71 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  28.91 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.53 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  32.82 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
269 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  28.91 
 
 
269 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.7 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  37.5 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.8 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 
269 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
269 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 
263 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  28.91 
 
 
269 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  41.56 
 
 
219 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  28.12 
 
 
269 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 
392 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  28.91 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  28.91 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  28.1 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
396 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.13 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.07 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.73 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.73 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  30.33 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
272 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
279 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.99 
 
 
263 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>