More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1421 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.39 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 		 338 aa  338  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.97 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.71 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.51 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.49 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.82 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.84 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  44.9 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.66 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.11 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.52 
 
 		 338 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  42.98 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.94 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.15 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.15 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  42.15 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.15 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.85 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.85 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.85 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.85 
 
 		 340 aa  262  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.64 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  40.18 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  39.12 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  38.24 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  38.53 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  38.53 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  38.53 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.95 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.19 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.35 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  31.66 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.03 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  35.17 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  33.64 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  33.75 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  33.03 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  31.9 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.61 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  31.61 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.12 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  38.17 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  31.21 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  32.18 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  31.32 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.9 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  32.18 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.49 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  32.75 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  31.76 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.18 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.45 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.62 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.84 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.24 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  31.01 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>