78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0723 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  808    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  65.75 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  61.62 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  57.21 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  55.7 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  42.65 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 480 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.74 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  27.7 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  21.67 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  22.38 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  26.19 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  23.2 
 
 		 477 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  20.81 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4906  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.24 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.24 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  22.29 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  28.24 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.24 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  21.95 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  22.56 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  22.56 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 450 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.99 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  22.56 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  27.59 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 445 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  23.08 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>