More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0520 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 357 aa  731    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  37.43 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  34.96 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  31.73 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  29.66 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  28.05 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3344  LacI family transcription regulator  24.56 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000247508  normal  0.28725 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6417  transcriptional regulator, LacI family  25.73 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.308696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1273  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690479  normal  0.464458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  28.18 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4585  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  27.03 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  26.2 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  24.46 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2844  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  25.66 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  24.41 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  30.15 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2667  gluconate utilization system gnt-I transcriptional repressor  23.12 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2434  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.44 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  28.18 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.45 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.63 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.55 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  26 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  23.81 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.84 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2967  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4113  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  22.49 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3954  LacI family transcription regulator  22.49 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.647552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3965  LacI family transcription regulator  22.49 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4230  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.49 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4433  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  22.49 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.73 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  23.99 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  23.65 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  24.04 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  24.68 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6321  LacI family transcription regulator  27.98 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.44 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.04 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2762  alanine racemase  37.74 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  30.69 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2882  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3019  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  50.94 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.5 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.73 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  22.46 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.57 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  24.45 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  21.39 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  46.43 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  25.15 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.81 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  22.97 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  26.03 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2498  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3695  LacI family transcription regulator  25.76 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  25.25 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  29.09 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2058  transcriptional regulator of LacI family protein  23.45 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  27.15 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4286  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  22.22 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  25.13 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  50.88 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>