220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0643 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  72.87 
 
 		 334 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  54.29 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  38.28 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  36.18 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  34.1 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  34.64 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  31.86 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  31.55 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  28.2 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  30.89 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  25.9 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.21 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  31.86 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  31.83 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.75 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.75 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.75 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.75 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.43 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  26.47 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.14 
 
 		 694 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  29.97 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  28.3 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.33 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  26.14 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.47 
 
 		 700 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  25.82 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  27.76 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  26.14 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  27.85 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.83 
 
 		 695 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  29.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  27.65 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  29.15 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  26.13 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  27.67 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.33 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  25.48 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  25.39 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  27.46 
 
 		 694 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  27 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  25.08 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  25.08 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  25.08 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>