More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0586 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  96.92 
 
 
292 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  96.85 
 
 
439 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  78.77 
 
 
292 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  78.42 
 
 
292 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  80.48 
 
 
292 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  79.45 
 
 
292 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  75.6 
 
 
293 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  68.86 
 
 
279 aa  384  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  62.8 
 
 
288 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  65.37 
 
 
285 aa  348  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  63.96 
 
 
286 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  65.6 
 
 
285 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  64.31 
 
 
287 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  63.14 
 
 
285 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  65.25 
 
 
285 aa  345  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  63.48 
 
 
284 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  65.14 
 
 
285 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  63.14 
 
 
284 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  66.32 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  59.29 
 
 
274 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  62.16 
 
 
289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  65.52 
 
 
277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  64.16 
 
 
284 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  61.05 
 
 
273 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  65.19 
 
 
287 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  63.21 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  63.21 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  59.18 
 
 
291 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  62.81 
 
 
284 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  62.81 
 
 
284 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  56.74 
 
 
284 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  56.43 
 
 
268 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  59.64 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  55.63 
 
 
291 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  58.93 
 
 
266 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  58.93 
 
 
266 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  54.2 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  55.05 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  49.46 
 
 
283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  44.8 
 
 
274 aa  226  3e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  43.57 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  44.33 
 
 
274 aa  218  7e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  45.04 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
291 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  42.19 
 
 
291 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  39.87 
 
 
288 aa  192  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  39.67 
 
 
297 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  40.86 
 
 
291 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  41.39 
 
 
295 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.53 
 
 
291 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  39.93 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  40.74 
 
 
286 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  40.96 
 
 
289 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  40.41 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 
284 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  40.96 
 
 
289 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  41.47 
 
 
298 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  41.24 
 
 
288 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  47.01 
 
 
284 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.73 
 
 
295 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  40.65 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.26 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.39 
 
 
295 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  39.26 
 
 
295 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.27 
 
 
295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 
286 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  39.39 
 
 
286 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  36.75 
 
 
293 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 
286 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.18 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  40.89 
 
 
290 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 
293 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 
293 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  36.18 
 
 
286 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  38.49 
 
 
294 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  38.74 
 
 
293 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  37.21 
 
 
293 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  39.38 
 
 
283 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  36.79 
 
 
291 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  36.24 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 
293 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  37.29 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  37.67 
 
 
293 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  38.7 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 
291 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 
291 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  36.67 
 
 
293 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  37 
 
 
293 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.79 
 
 
291 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  36.12 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  43.03 
 
 
284 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.79 
 
 
291 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 
293 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  38.21 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>