More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49993 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_49993  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  100 
 
 
521 aa  1059    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  34.92 
 
 
645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  33.73 
 
 
614 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  34.71 
 
 
586 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  35.28 
 
 
1408 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
623 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  35.75 
 
 
603 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.72 
 
 
596 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.09 
 
 
601 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  35.94 
 
 
581 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  34.9 
 
 
586 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
601 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
598 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.85 
 
 
594 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.11 
 
 
782 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.74 
 
 
598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  33.47 
 
 
646 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.2 
 
 
634 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.56 
 
 
601 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.05 
 
 
601 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.9 
 
 
600 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.29 
 
 
632 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  35.12 
 
 
1284 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.21 
 
 
600 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  33.73 
 
 
597 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.14 
 
 
590 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.9 
 
 
605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.6 
 
 
605 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.19 
 
 
556 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.14 
 
 
639 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.6 
 
 
600 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.62 
 
 
586 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  34.62 
 
 
611 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 
597 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.63 
 
 
608 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.21 
 
 
580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.11 
 
 
641 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.13 
 
 
628 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  36.29 
 
 
606 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  34.57 
 
 
1343 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37 
 
 
681 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.19 
 
 
582 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37 
 
 
599 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.68 
 
 
608 aa  236  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
619 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  34.49 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.98 
 
 
586 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  33.2 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.26 
 
 
587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.32 
 
 
619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.55 
 
 
627 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.84 
 
 
586 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30672  ATP-binding transporter  31.25 
 
 
828 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104543  normal  0.0203456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 
589 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
572 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 
606 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.55 
 
 
650 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  34.25 
 
 
594 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.1 
 
 
603 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.3 
 
 
603 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.65 
 
 
589 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.27 
 
 
598 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  30.42 
 
 
602 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.58 
 
 
597 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  32.77 
 
 
585 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.31 
 
 
614 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
581 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.92 
 
 
596 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30.33 
 
 
638 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.04 
 
 
587 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.14 
 
 
616 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 
601 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.1 
 
 
575 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.91 
 
 
700 aa  224  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.79 
 
 
579 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.9 
 
 
603 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  30.8 
 
 
580 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.25 
 
 
582 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.19 
 
 
597 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.51 
 
 
629 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.11 
 
 
602 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  34.45 
 
 
649 aa  223  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.9 
 
 
602 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
593 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.42 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.85 
 
 
608 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.59 
 
 
586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.04 
 
 
587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  32.11 
 
 
592 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.22 
 
 
699 aa  221  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  33.04 
 
 
647 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  30.59 
 
 
580 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.9 
 
 
602 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.76 
 
 
590 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  30.45 
 
 
578 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.16 
 
 
603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
650 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.82 
 
 
580 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.19 
 
 
592 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.8 
 
 
616 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>