More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0440 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  909    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  67.13 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  51.82 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 425 aa  411  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 423 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 439 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  46 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>