More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1900 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  100 
 
 		 453 aa  913    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  85.62 
 
 		 453 aa  784    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  66.08 
 
 		 452 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  67.41 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  64.96 
 
 		 453 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  66.74 
 
 		 452 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  67.19 
 
 		 453 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  56.82 
 
 		 452 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  51.66 
 
 		 473 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  51.12 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  51.24 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  48.88 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  50.22 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  49.01 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  48.79 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  48.79 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  48.64 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  47.68 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  49.66 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  46.24 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  46.68 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  47.87 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  46.9 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  47.12 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  44.04 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  46.9 
 
 		 485 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  46.47 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  41.52 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  42.34 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  40.31 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  40.32 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  43.97 
 
 		 459 aa  339  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  41.74 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  42.19 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  41.29 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  41.29 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  41.2 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  38.15 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  40.27 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  39.73 
 
 		 544 aa  318  9e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  38.29 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.89 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.04 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.29 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.89 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.73 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  30.79 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  33.26 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.89 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.34 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.44 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  33.18 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.48 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  33.04 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  31.82 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  31.07 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  31.06 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.53 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.69 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  31.31 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  30.79 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.04 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.29 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.75 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  29.05 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  32.05 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  30.45 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  30.41 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  31.56 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  31.15 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.84 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.05 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.49 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  31.07 
 
 		 436 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  31.07 
 
 		 436 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  31.33 
 
 		 437 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  30.18 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.32 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  31.33 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  31.43 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  30.18 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  31.07 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.82 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  29.95 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  30.93 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  31.91 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  31.15 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  31.69 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  31.69 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  30.7 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.72 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.6 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.58 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  30.7 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  30.7 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  31.69 
 
 		 434 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>