202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1437 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1437  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.483807  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  86.3 
 
 
388 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0078  major facilitator superfamily transporter  35.43 
 
 
400 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  28.2 
 
 
414 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  29.24 
 
 
426 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  29.06 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  26.43 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  29.07 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  28.53 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  27.95 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  27.95 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  29.5 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  29.02 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  27.95 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  24.14 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  27.95 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  27.32 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  27.27 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
398 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  27.03 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  26.09 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  26.61 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  29.66 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  27.25 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  30.57 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  24.52 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  29.97 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  29.36 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  27.4 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  28.69 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  27.22 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  23.91 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  27.22 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  25.34 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  26.07 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  29.23 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  26.52 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  28.19 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  26.05 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  24.32 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.89 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  26.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  26.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  26.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  26.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  26.33 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  26.55 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  26.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  27.74 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  28.91 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  25.53 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.44 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  27.75 
 
 
455 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  26.95 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  26.35 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  22.05 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  28.22 
 
 
408 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  29.28 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  29.14 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  30.74 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  26.02 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  25.42 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  26.01 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  32.07 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  29.13 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  25.85 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  31.25 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  25.43 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  24.32 
 
 
439 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  26.89 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  24.28 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  31.06 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  20.99 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>