More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0552 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 455 aa  934    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  84.77 
 
 		 453 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  52.85 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  53.1 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  49.75 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  48.14 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  48.32 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  47.04 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  49.02 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  47.07 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  49.38 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 407 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  49.38 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  43.89 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  43.99 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  48.88 
 
 		 409 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  46.27 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  40.79 
 
 		 407 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  44.31 
 
 		 415 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 		 411 aa  339  8e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  42.79 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  42.82 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  42.52 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  42.31 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  43.63 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  43.45 
 
 		 369 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 		 425 aa  302  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  40.44 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  38.58 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  41.69 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 		 518 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  35.73 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  34.37 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  55.96 
 
 		 188 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  55.96 
 
 		 188 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.57 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.11 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.96 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.31 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  29.41 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  24.08 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.26 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.97 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  25.1 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 756 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>