62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2504 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  58.09 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  31 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  31.43 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  30.19 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  27.93 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.75 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  32.59 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.2 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  29.31 
 
 		 415 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.68 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.08 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  26.75 
 
 		 382 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  26.63 
 
 		 388 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  26.16 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 404 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  24.53 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  24.53 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  31.08 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  26.62 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  27.18 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  25.58 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.65 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  24.29 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  22.04 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.11 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  26.67 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  29.66 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  31.15 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  27.73 
 
 		 355 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  28.67 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  24.4 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  27.74 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  32.38 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.92 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  24.4 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  25.47 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  32.97 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  33.04 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 372 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  33.11 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.53 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  29.5 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 346 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.93 
 
 		 352 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.47 
 
 		 283 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  35.04 
 
 		 153 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>