More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4945 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2648  regulatory protein MerR  46.97 
 
 		 183 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  54.69 
 
 		 319 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  31.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  34.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  29.92 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.54 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 342 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 342 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.33 
 
 		 342 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 319 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  29.92 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  26.96 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  41.67 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  29.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 334 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  34.21 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  28.04 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 343 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 299 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>