More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4454 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  72.59 
 
 		 726 aa  1075    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  62.83 
 
 		 729 aa  902    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  65.23 
 
 		 714 aa  904    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  65.66 
 
 		 724 aa  939    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  49.24 
 
 		 727 aa  732    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  62.83 
 
 		 729 aa  901    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  65.19 
 
 		 728 aa  904    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  100 
 
 		 726 aa  1476    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  34.79 
 
 		 675 aa  331  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  29.61 
 
 		 791 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  33.57 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  32.66 
 
 		 823 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  32.1 
 
 		 680 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.79 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  28.53 
 
 		 668 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  30.42 
 
 		 657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  28.94 
 
 		 658 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  27.63 
 
 		 659 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  33.38 
 
 		 666 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  27.13 
 
 		 659 aa  237  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  31.52 
 
 		 736 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  28.13 
 
 		 659 aa  230  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  31.06 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3854  dehydrogenase E1 component  31.56 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.886533  normal  0.152539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  29.51 
 
 		 702 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  30.92 
 
 		 617 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2363  dehydrogenase E1 component  40.31 
 
 		 332 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.706778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  41.67 
 
 		 325 aa  211  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  38.08 
 
 		 324 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  40.57 
 
 		 332 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  28.62 
 
 		 652 aa  207  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  34.37 
 
 		 325 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.54 
 
 		 328 aa  201  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  38.8 
 
 		 326 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  36.02 
 
 		 327 aa  200  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  36.02 
 
 		 327 aa  200  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  36.28 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  38.54 
 
 		 327 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  34.37 
 
 		 325 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  36.59 
 
 		 324 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  38.15 
 
 		 328 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0878  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, alpha subunit  37.35 
 
 		 322 aa  196  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00306772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  33.64 
 
 		 325 aa  196  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  38.34 
 
 		 327 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.89 
 
 		 449 aa  193  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  37.78 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  38.12 
 
 		 327 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  35.89 
 
 		 328 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  36.88 
 
 		 328 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.87 
 
 		 456 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  38.44 
 
 		 327 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  35.89 
 
 		 326 aa  192  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  36.59 
 
 		 328 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  38.12 
 
 		 332 aa  190  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.01 
 
 		 345 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  36.58 
 
 		 326 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1796  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.95 
 
 		 348 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281194  hitchhiker  0.0011937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.73 
 
 		 469 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2539  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  36.02 
 
 		 332 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.73 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  38.58 
 
 		 320 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  37.14 
 
 		 469 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2780  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  36.02 
 
 		 332 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0316753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.42 
 
 		 483 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  37.5 
 
 		 327 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.41 
 
 		 463 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  38.94 
 
 		 330 aa  188  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  36.45 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  35.93 
 
 		 464 aa  188  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  35.54 
 
 		 334 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2588  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  35.95 
 
 		 332 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  187  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2776  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  35.95 
 
 		 332 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2059  dehydrogenase E1 component  38.8 
 
 		 346 aa  187  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1908  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  36.89 
 
 		 381 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2825  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  35.95 
 
 		 332 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  35.58 
 
 		 328 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.1 
 
 		 463 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1603  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.54 
 
 		 348 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.25 
 
 		 463 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1630  dehydrogenase, E1 component  39.16 
 
 		 360 aa  187  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0754823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  36.33 
 
 		 326 aa  187  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.83 
 
 		 459 aa  187  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2505  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  36.86 
 
 		 332 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  38.82 
 
 		 330 aa  186  9e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2804  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  35.95 
 
 		 332 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  36.71 
 
 		 343 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0534  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha  37.7 
 
 		 339 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.19 
 
 		 465 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  37.93 
 
 		 325 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2578  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  35.95 
 
 		 332 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000958625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  37.93 
 
 		 325 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  37.93 
 
 		 325 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  37.38 
 
 		 460 aa  185  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  37.74 
 
 		 325 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3141  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  35.8 
 
 		 341 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.71 
 
 		 497 aa  184  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.71 
 
 		 480 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.83 
 
 		 464 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.34 
 
 		 458 aa  183  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>