More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4429 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.03 
 
 		 610 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8960  acyl-CoA dehydrogenase  63.5 
 
 		 607 aa  777    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0086  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.32 
 
 		 617 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4420  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.06 
 
 		 611 aa  795    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3327  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.52 
 
 		 610 aa  840    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.429773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0210  putative acyl-CoA dehydrogenase  67.2 
 
 		 607 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.08 
 
 		 611 aa  776    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0268074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0430  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.75 
 
 		 611 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0252  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.08 
 
 		 611 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5917  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.72 
 
 		 616 aa  731    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3018  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.77 
 
 		 619 aa  745    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1531  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.04 
 
 		 615 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.08 
 
 		 611 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.235095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0265  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.21 
 
 		 611 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.746207  normal  0.13974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0053  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.62 
 
 		 614 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5295  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.46 
 
 		 621 aa  752    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26500  acyl-CoA dehydrogenase  62.82 
 
 		 617 aa  785    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.348729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0238  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.11 
 
 		 611 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6963  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.49 
 
 		 612 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4833  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.82 
 
 		 614 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38750  acyl-CoA dehydrogenase  64.79 
 
 		 614 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.802749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.76 
 
 		 605 aa  799    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10247  acyl-CoA dehydrogenase fadE5  61.96 
 
 		 611 aa  764    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0271  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.43 
 
 		 610 aa  835    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.76 
 
 		 617 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0242  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  63.08 
 
 		 611 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1508  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  64.04 
 
 		 615 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8827  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.6 
 
 		 609 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11495  acyl-CoA dehydrogenase fadE15  56.5 
 
 		 609 aa  673    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000443492  normal  0.167351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1508  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.54 
 
 		 633 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7271  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.77 
 
 		 609 aa  746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 621 aa  1275    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00413349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2618  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.72 
 
 		 611 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.72 
 
 		 611 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2647  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.72 
 
 		 611 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.17 
 
 		 601 aa  347  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000727045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.52 
 
 		 605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000583422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1305  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.97 
 
 		 604 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000712718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5060  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.35 
 
 		 609 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2270  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.65 
 
 		 615 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000247308  hitchhiker  0.000246655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.76 
 
 		 598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  33.65 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.49 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.49 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.49 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.49 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2211  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.04 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0172956  normal  0.0102784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.28 
 
 		 591 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2845  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.06 
 
 		 600 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.34 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1493  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.74 
 
 		 593 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.8 
 
 		 595 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  33.76 
 
 		 597 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.17 
 
 		 598 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.7 
 
 		 595 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.7 
 
 		 596 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3245  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.7 
 
 		 596 aa  296  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.532993  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.91 
 
 		 595 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.91 
 
 		 595 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.91 
 
 		 595 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.39 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  34.02 
 
 		 595 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.36 
 
 		 601 aa  296  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.690717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1555  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.7 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000406482  normal  0.0195693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.65 
 
 		 594 aa  296  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0656  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.16 
 
 		 586 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2265  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.59 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.086163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66350  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.82 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.48 
 
 		 595 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0227  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  34.6 
 
 		 592 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.23 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.07 
 
 		 600 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.44 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5757  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0148  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.7 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1225  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.14 
 
 		 596 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311938  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.75 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.53 
 
 		 600 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.59 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.7 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.28 
 
 		 595 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.59 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.42 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.27 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.54 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1557  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.33 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.538695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.01 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.77864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.06 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0561  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.03 
 
 		 622 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.86 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0137  acyl-CoA dehydrogenase  33.65 
 
 		 606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.86 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.43 
 
 		 595 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.71 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>