More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3285 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.28 
 
 		 736 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 733 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.86 
 
 		 757 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.04 
 
 		 733 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.59 
 
 		 725 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.64 
 
 		 747 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.46 
 
 		 718 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.36 
 
 		 726 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.82 
 
 		 723 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.37 
 
 		 749 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.31 
 
 		 747 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.71 
 
 		 733 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.79 
 
 		 733 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.72 
 
 		 722 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.46 
 
 		 746 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.48 
 
 		 741 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 750 aa  1498    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.03 
 
 		 760 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.13 
 
 		 759 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.53 
 
 		 748 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  51.93 
 
 		 739 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.9 
 
 		 758 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 756 aa  628  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.81 
 
 		 750 aa  618  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.51 
 
 		 781 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  47.92 
 
 		 741 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.55 
 
 		 752 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.64 
 
 		 741 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.64 
 
 		 741 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.51 
 
 		 741 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.12 
 
 		 753 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.22 
 
 		 737 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.85 
 
 		 752 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.8 
 
 		 778 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 		 730 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  43.7 
 
 		 739 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.48 
 
 		 819 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.48 
 
 		 819 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.79 
 
 		 818 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 817 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 815 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.03 
 
 		 704 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.15 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.82 
 
 		 701 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.89 
 
 		 778 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.01 
 
 		 846 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 		 812 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.14 
 
 		 842 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.76 
 
 		 827 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.94 
 
 		 767 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.74 
 
 		 846 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 		 792 aa  422  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.68 
 
 		 862 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.83 
 
 		 702 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 		 772 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.71 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 		 698 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.94 
 
 		 772 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.96 
 
 		 827 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.48 
 
 		 706 aa  415  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.86 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 		 842 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  36.5 
 
 		 700 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.37 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 706 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.86 
 
 		 689 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.82 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 		 686 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.53 
 
 		 829 aa  406  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  35.34 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.51 
 
 		 786 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.32 
 
 		 694 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 740 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.07 
 
 		 822 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.84 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.24 
 
 		 717 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.05 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.22 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.01 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.29 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.75 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.84 
 
 		 822 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.86 
 
 		 818 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.13 
 
 		 707 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.73 
 
 		 815 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 719 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  41.36 
 
 		 943 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.18 
 
 		 681 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.94 
 
 		 779 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.07 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.84 
 
 		 787 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.74 
 
 		 846 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.6 
 
 		 850 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 		 832 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.05 
 
 		 695 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.67 
 
 		 679 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>