More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2056 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  40.25 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  35.03 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  33.86 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  41.14 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  34.52 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  37.11 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  36.42 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  36.42 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  37.11 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  30.05 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  35.8 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.64 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  27 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.7 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  27.14 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  27 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  27 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  27 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.92 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  27 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  28.92 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.5 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  27.32 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.95 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.71 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  28.92 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.62 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30.91 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  31.73 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.3 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.13 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.86 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  25.37 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.89 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.03 
 
 		 521 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  26.11 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  28.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  25 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.86 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  27.09 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.29 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.37 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.14 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  25.45 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  25.45 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.5 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1136  membrane protein, DedA family  34.81 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.14 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.15 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  26.09 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  30.32 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.48 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  29.07 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  32.1 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.35 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  29.15 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.71 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.86 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  31.25 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.5 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  25.51 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  29.81 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  25.15 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  31.14 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  30.94 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.07 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1082  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.46 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  28.77 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  27.13 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  28.75 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  25.97 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>