More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0751 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  44.55 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  44.14 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.84 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  36.61 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  48.24 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  37.78 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  47.67 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  42.86 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  41.96 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  43.66 
 
 		 207 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  42.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  45.07 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  35.16 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  35.16 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  38.27 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.78 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  41.41 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  40.66 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  48.53 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  42.35 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.19 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  41.67 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  43.06 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  39.56 
 
 		 234 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  36.59 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.56 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  47.89 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  45.83 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.54 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  43.02 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  43.02 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.63 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  39.78 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  37.18 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  33.03 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  43.02 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  36.61 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  41.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  44.3 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  43.68 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  35.65 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  37.72 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  42.35 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  39.74 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  42.35 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  45.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  45.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.61 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  41.86 
 
 		 545 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 199 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>