193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1607 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  59.04 
 
 
706 aa  800    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 
687 aa  1407    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  50 
 
 
625 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  49.14 
 
 
631 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  49.7 
 
 
647 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  48.17 
 
 
677 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  47.58 
 
 
676 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  41.86 
 
 
840 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  42.43 
 
 
698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  38.01 
 
 
1094 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  33.2 
 
 
708 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  34.76 
 
 
620 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  32.75 
 
 
625 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.86 
 
 
523 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  27.26 
 
 
872 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  29.35 
 
 
661 aa  217  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  27.15 
 
 
779 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  26.89 
 
 
779 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  27.65 
 
 
647 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  29.22 
 
 
734 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.94 
 
 
536 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  28.42 
 
 
643 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.8 
 
 
508 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  26.93 
 
 
798 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.61 
 
 
528 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.35 
 
 
515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  25.74 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  28.7 
 
 
798 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.71 
 
 
799 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.23 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.31 
 
 
496 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  28.03 
 
 
487 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.91 
 
 
679 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  27.65 
 
 
490 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  26.06 
 
 
536 aa  124  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.23 
 
 
569 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  26.86 
 
 
486 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.5 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25 
 
 
504 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  24.17 
 
 
547 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  26.71 
 
 
506 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25 
 
 
519 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  24.43 
 
 
510 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.32 
 
 
499 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  25.63 
 
 
1272 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.16 
 
 
532 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  25.37 
 
 
534 aa  96.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  25.37 
 
 
534 aa  96.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.34 
 
 
1363 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  30.11 
 
 
502 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  30.11 
 
 
502 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 
1363 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.68 
 
 
1380 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  24.72 
 
 
760 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 
492 aa  91.3  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  25 
 
 
505 aa  89  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  25.81 
 
 
488 aa  86.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  25.33 
 
 
603 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.6 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  25.17 
 
 
1430 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.62 
 
 
1201 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  25.44 
 
 
493 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  22.59 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  25.44 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  24.2 
 
 
516 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  23.77 
 
 
529 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.55 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  24.66 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  22.13 
 
 
533 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  23.77 
 
 
529 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  23.77 
 
 
529 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  23.98 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  25.22 
 
 
877 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  25.11 
 
 
519 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  23.55 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  22.42 
 
 
513 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  23.55 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  23.55 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  23.55 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  24.77 
 
 
533 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  29 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.24 
 
 
1736 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  21.96 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  26.16 
 
 
1247 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  21.43 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  29.37 
 
 
1303 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  30 
 
 
470 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  30 
 
 
470 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.3 
 
 
1973 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  30 
 
 
470 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  30 
 
 
470 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  28 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  28 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  28 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  28 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  29.31 
 
 
1601 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  28.64 
 
 
516 aa  72.4  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>