163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0805 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 152 aa  313  7e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  43.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  40.13 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  40.97 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  36.84 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  40.15 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  37.25 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  36.54 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  36.6 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  41.54 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  38.16 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  37.68 
 
 		 198 aa  104  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  37.25 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  40.15 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  38.64 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  33.99 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  33.99 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  33.99 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  35.06 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  36.92 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  35.71 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  37.21 
 
 		 185 aa  94.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  34.56 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  33.33 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  38.46 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.11 
 
 		 183 aa  83.6  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  32.21 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  32.52 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  32.56 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  41.79 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  43.28 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  29.93 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  38.55 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  36.9 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  39.76 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  42.47 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  42.47 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  31.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  25.4 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  27.61 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  27.61 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  30 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  33.71 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  29.32 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  29.32 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  29.37 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  37.18 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  31.4 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  26.09 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  31.15 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 110 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  35.71 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  31.3 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  34.85 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>