More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1619 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 126 aa  169  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  69.05 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  68.03 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  65.08 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  67.21 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  66.39 
 
 		 129 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  65.12 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  65.08 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  63.49 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  63.49 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  62.3 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  62.3 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  63.78 
 
 		 127 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  60.66 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  61.48 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  60.32 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  63.78 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  60.66 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  60.47 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  60.47 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  62.2 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  60.8 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  61.42 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  61.42 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  58.73 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  58.4 
 
 		 125 aa  140  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  51.4 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 109 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 109 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  49.51 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2835  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000576673  normal  0.189741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3639  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000767694  hitchhiker  0.0000000000152117 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2627  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00739317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3483  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3771  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3452  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000048605  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0332  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268169  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3164  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000561791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3741  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000060357  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1929  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000352349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3063  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000747087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0319  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000843576  decreased coverage  0.00242293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3799  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638479  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2754  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000226308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0254  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00176884  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0272  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00175067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0281  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617614  normal  0.0696934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0353  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000911683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3014  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000615248  decreased coverage  0.00191029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>