More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1845 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 129 aa  256  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  92.25 
 
 		 129 aa  238  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  90.7 
 
 		 129 aa  234  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  89.92 
 
 		 129 aa  230  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  89.92 
 
 		 129 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  89.92 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  89.15 
 
 		 129 aa  227  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  82.95 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  82.95 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  88.03 
 
 		 129 aa  207  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  79.67 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  79.03 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  75.4 
 
 		 127 aa  189  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  76.19 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  75.4 
 
 		 127 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  72.66 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  74.22 
 
 		 128 aa  185  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  71.88 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  72.09 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  74.22 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  74.22 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  75.61 
 
 		 126 aa  183  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  70.31 
 
 		 128 aa  182  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  75.61 
 
 		 127 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  71.77 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  67.44 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  69.92 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  69.11 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  69.92 
 
 		 126 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  67.72 
 
 		 134 aa  167  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  68.29 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  65.12 
 
 		 126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  72.36 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  66.94 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  63.41 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  65.04 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  62.2 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  52.83 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  56.86 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  52.34 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3994  ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000855576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  59.79 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  59.79 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  57.73 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0261  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  49.06 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0208  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.813634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 111 aa  100  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1929  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000352349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0319  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000843576  decreased coverage  0.00242293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3483  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3639  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000767694  hitchhiker  0.0000000000152117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>