More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1254 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 125 aa  247  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  83.87 
 
 		 126 aa  213  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  83.06 
 
 		 127 aa  207  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  65.6 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  65.04 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  63.71 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  65.04 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  62.9 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  65.04 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  64.23 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  62.6 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  63.2 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  64.23 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  61.6 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  62.9 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  62.3 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  60.16 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  59.84 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  60.66 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  58.87 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  62.1 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  60.66 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  59.02 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  58.87 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  58.06 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  59.02 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  58.06 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  60.16 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  61.48 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  59.35 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  58.4 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  56 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  57.26 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  56.45 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  57.26 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  56.45 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  56.45 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  57.85 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  49.53 
 
 		 113 aa  93.2  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  47.57 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0414  50S ribosomal protein L22  45.63 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.249175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  52.58 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  47.92 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  47.92 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  46.46 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  48.11 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  53.41 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  42.99 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  50.52 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  49.48 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  47.47 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  40.18 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>