More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0283 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  96.36 
 
 
110 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  96.36 
 
 
110 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  93.64 
 
 
110 aa  212  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3790  50S ribosomal protein L22  89.81 
 
 
109 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3438  50S ribosomal protein L22  88.89 
 
 
109 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00633436  normal  0.213311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0261  50S ribosomal protein L22  88.89 
 
 
109 aa  196  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1269  50S ribosomal protein L22  88.18 
 
 
110 aa  196  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000688377  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0208  50S ribosomal protein L22  87.96 
 
 
109 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.813634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3994  ribosomal protein L22  82.41 
 
 
109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000855576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  83.33 
 
 
109 aa  181  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  77.78 
 
 
109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  76.85 
 
 
109 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  74.07 
 
 
109 aa  161  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0772  ribosomal protein L22  72.22 
 
 
115 aa  160  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0420654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3014  50S ribosomal protein L22  70.37 
 
 
109 aa  159  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000615248  decreased coverage  0.00191029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3312  50S ribosomal protein L22  72.22 
 
 
109 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000860749  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  70.37 
 
 
109 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2835  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000576673  normal  0.189741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2627  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00739317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3483  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3771  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3452  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000048605  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0281  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617614  normal  0.0696934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0254  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00176884  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3741  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000060357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3063  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000747087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3799  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0332  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268169  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2754  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000226308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3164  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000561791  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0272  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00175067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0353  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000911683  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1929  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
109 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000352349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3639  50S ribosomal protein L22  66.36 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000767694  hitchhiker  0.0000000000152117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0319  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
109 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000843576  decreased coverage  0.00242293 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0055  50S ribosomal protein L22  66.36 
 
 
111 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185707  hitchhiker  6.04207e-20 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0058  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
109 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000680937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  65.45 
 
 
110 aa  144  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
110 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
110 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  67.59 
 
 
110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  62.96 
 
 
110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  67.59 
 
 
110 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  67.59 
 
 
110 aa  135  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
110 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  68.69 
 
 
110 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  67.59 
 
 
110 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  64.81 
 
 
109 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
110 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
110 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 
110 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  67.68 
 
 
110 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  61.68 
 
 
111 aa  133  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  64.22 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  61.68 
 
 
111 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  68.69 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  68.69 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  62.96 
 
 
111 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
110 aa  129  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  64.65 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
109 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
109 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  62.75 
 
 
110 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  57.41 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  57.41 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  63.21 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0438  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00481057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  59.26 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  59.26 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06300  50S ribosomal protein L22  67.03 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>