More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1941 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  76.8 
 
 		 134 aa  202  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  66.94 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  66.12 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  63.28 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  66.12 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  66.12 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  68.38 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  66.12 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  62.02 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  61.98 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  61.98 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  64.46 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  61.72 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  61.72 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  61.72 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  60.16 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  59.38 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  63.87 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  60.16 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  61.98 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  59.02 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  60.33 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  57.81 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  60.33 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  57.85 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  58.4 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  58.82 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  55.47 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  55.37 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  55.37 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  57.85 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  55.37 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  53.91 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  53.6 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  53.91 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  60.33 
 
 		 126 aa  124  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0438  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00481057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0499  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00322381  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  43.59 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3994  ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000855576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  42.74 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  41.82 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0414  50S ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 110 aa  84  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.249175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  40.91 
 
 		 113 aa  84  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  43.64 
 
 		 113 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  42.24 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  40.35 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  43.59 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  41.12 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  45.63 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3639  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000767694  hitchhiker  0.0000000000152117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0319  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000843576  decreased coverage  0.00242293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  40.28 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  38.53 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  39.47 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  39.42 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  39.47 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>