More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1790 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  75.4 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  73.02 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  77.05 
 
 		 127 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  73.81 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  73.02 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  74.4 
 
 		 128 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  76.23 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  76.23 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  72.22 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  74.59 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  73.17 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  73.77 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  72.8 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  70.63 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  72.36 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  72.09 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  76.07 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  72.22 
 
 		 126 aa  179  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  69.35 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  69.35 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  69.35 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  70.97 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  70.97 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  71.43 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  69.05 
 
 		 126 aa  173  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  67.46 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  67.46 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  67.46 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 128 aa  166  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 128 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  65.08 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  60.33 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  59.5 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  52.83 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  52.34 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  55.66 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0396  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0261  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  55.56 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0208  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.813634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  49.04 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3790  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  52.83 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>