More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2683 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 126 aa  253  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  67.46 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  67.44 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  68.6 
 
 		 128 aa  173  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  66.93 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  66.94 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  65.12 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  66.94 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 126 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  66.14 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  66.14 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  66.93 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  66.12 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  65.35 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  62.02 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  62.02 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  65.29 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  63.57 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  63.57 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  62.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  62.81 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  61.98 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  59.5 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  61.16 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  69.05 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  59.02 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  56.35 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  53.77 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  46.23 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  52.48 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  47.12 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  42.59 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  47.71 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  42.34 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  50.47 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0414  50S ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.249175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  44.34 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  44.14 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0499  50S ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00322381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  49.49 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>