More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1721 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  96.83 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  84.13 
 
 		 126 aa  220  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  81.75 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  80.95 
 
 		 126 aa  215  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  80.16 
 
 		 126 aa  213  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  71.43 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  69.05 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1790  50S ribosomal protein L22  74.6 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130008  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  70.49 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  69.67 
 
 		 127 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  69.67 
 
 		 127 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  68.03 
 
 		 128 aa  167  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  68.03 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  65.87 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  67.21 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  64.34 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  64.52 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  65.08 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  67.21 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  63.49 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  66.39 
 
 		 127 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  66.39 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  63.71 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  66.39 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  63.71 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  65.57 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  62.9 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  62.02 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  62.9 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  63.11 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  63.11 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  58.73 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  57.85 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  56.45 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  55.37 
 
 		 153 aa  129  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  51.46 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  51.89 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  48.11 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  50.47 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>