More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0414 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0414  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 110 aa  220  6e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.249175  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  91.82 
 
 		 114 aa  209  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0676  50S ribosomal protein L22  61 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0432957  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  58.16 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  49 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  48 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  47.92 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  49.04 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  44.12 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  44.12 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  44.79 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  45.63 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  43 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  43.88 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  45 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  43.14 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  45.63 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  42.31 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  41.41 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  42.71 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  42.71 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  41.84 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  43 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  42 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  42.16 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  41.84 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  41.84 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  41.84 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  40.82 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  42.57 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  38.68 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  41.75 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0324  50S ribosomal protein L22  47.78 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000207674  unclonable  0.0000000386727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  41.84 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  43.43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  38.32 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  39.6 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  39.6 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3790  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  40.21 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  40.21 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>