More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0369 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
321 aa  661    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.37 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.32 
 
 
317 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.63 
 
 
317 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.73 
 
 
314 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  44.69 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
317 aa  269  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.77 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.14 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
332 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.96 
 
 
336 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
328 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
327 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
345 aa  143  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.71 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
287 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
345 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.86 
 
 
335 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  28.71 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.59 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.91 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  28.71 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  28.71 
 
 
339 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.71 
 
 
339 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.7 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 
344 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  27.85 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.4 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
362 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.93 
 
 
342 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.54 
 
 
362 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
362 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.28 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.11 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.92 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.87 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.92 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.69 
 
 
343 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
338 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 
362 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 
369 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.71 
 
 
336 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.91 
 
 
343 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  26.84 
 
 
339 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.25 
 
 
339 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  28.25 
 
 
339 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.25 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.15 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  28.25 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.16 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.69 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  28.25 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  29.91 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  27.95 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
362 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  38.15 
 
 
343 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
337 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.54 
 
 
352 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  27.91 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.54 
 
 
353 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.71 
 
 
363 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.67 
 
 
367 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.84 
 
 
345 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.79 
 
 
379 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.54 
 
 
363 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.25 
 
 
363 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.54 
 
 
363 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.54 
 
 
430 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.25 
 
 
363 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.09 
 
 
367 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.44 
 
 
422 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.03 
 
 
324 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  28.2 
 
 
337 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
343 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.3 
 
 
347 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  27.51 
 
 
337 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>