More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2817 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1272  tryptophan synthase subunit beta  76.03 
 
 
443 aa  658    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2817  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 
423 aa  865    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3038  tryptophan synthase subunit beta  77.59 
 
 
431 aa  679    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.25263  normal  0.0776736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0855  tryptophan synthase, beta subunit  85.71 
 
 
439 aa  755    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1170  tryptophan synthase subunit beta  76.65 
 
 
416 aa  627  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  63.05 
 
 
426 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 
389 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.16 
 
 
413 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 
389 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.8 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  55.15 
 
 
415 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  53.88 
 
 
394 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  54.74 
 
 
409 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0193  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 
394 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  55.69 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  53.13 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  52.88 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 
409 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  52.88 
 
 
394 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  54.59 
 
 
418 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  55.17 
 
 
411 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  53.28 
 
 
410 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  53.86 
 
 
420 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.35 
 
 
409 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  54.94 
 
 
389 aa  432  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  54.27 
 
 
413 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  53.5 
 
 
406 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  55.56 
 
 
399 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  53.88 
 
 
414 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  53.38 
 
 
414 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  55.98 
 
 
393 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2859  tryptophan synthase, beta subunit  56.92 
 
 
391 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  54.01 
 
 
391 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 
434 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  53.52 
 
 
399 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  51.8 
 
 
405 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  52.62 
 
 
409 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 
394 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  51.8 
 
 
405 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  54.85 
 
 
392 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  53.38 
 
 
402 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  51.8 
 
 
405 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  53.52 
 
 
399 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  52.63 
 
 
402 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 
406 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  53.3 
 
 
409 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  53.13 
 
 
414 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  52.63 
 
 
414 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 
403 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  50.84 
 
 
405 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  52.83 
 
 
417 aa  418  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 
396 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  55.28 
 
 
432 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 
422 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  55.81 
 
 
671 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  54.14 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  54 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  52.46 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  54.43 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  55.28 
 
 
431 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  54 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.92 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 
405 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 
403 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 
399 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 
399 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  52.3 
 
 
393 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 
399 aa  411  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  54.19 
 
 
404 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  52.64 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  53.32 
 
 
402 aa  411  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  52.42 
 
 
401 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  51.97 
 
 
406 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  52.3 
 
 
397 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  53.87 
 
 
404 aa  411  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  53.65 
 
 
399 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 
395 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  52.01 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
411 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 
417 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  53.75 
 
 
410 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  52.5 
 
 
416 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 
397 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 
412 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 
410 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 
394 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>