53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1304 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1304  UspA domain protein  100 
 
 
155 aa  300  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.708291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3428  UspA domain protein  78.43 
 
 
153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1930  UspA domain protein  58.62 
 
 
149 aa  150  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  50.34 
 
 
150 aa  135  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  50.34 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  30.82 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.67 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  28.77 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32 
 
 
307 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.05 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  26.06 
 
 
207 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.57 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  26.23 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.94 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.61 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  27.92 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  27.63 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  30.34 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.82 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.25 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.46 
 
 
208 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.47 
 
 
294 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.53 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.28 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.76 
 
 
415 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  30.06 
 
 
295 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  32.43 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.2 
 
 
305 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.21 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  30.67 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.57 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.17 
 
 
288 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.82 
 
 
280 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.15 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.81 
 
 
301 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.77 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  29.05 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.38 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.62 
 
 
291 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.93 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  31.03 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  47.37 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  27.54 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.45 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  30 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  27.89 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.68 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.68 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>