88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0778 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 
291 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  44.23 
 
 
287 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  43.18 
 
 
307 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  44.32 
 
 
328 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 
342 aa  224  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 
328 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 
310 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  42.21 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  41.8 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 
267 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 
277 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  41.89 
 
 
267 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  41.13 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 
277 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 
253 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  32.44 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  32.05 
 
 
253 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 
254 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  30.94 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  27.52 
 
 
253 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 
262 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  24.88 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  24.74 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  24.88 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  25.89 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  24.29 
 
 
464 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  23.13 
 
 
264 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.02 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  23.9 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.1 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  26.17 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  22.93 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  25.9 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  32.65 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  29.59 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  36.9 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  36.9 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  34.21 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  29.94 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  47  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  33.75 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.97 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  33.75 
 
 
260 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  33.75 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  33.75 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  33.75 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  30.69 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  32.43 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  26.11 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.33 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  21.82 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  26.05 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  28.32 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  34.67 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  32.98 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  35.87 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  33.68 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  24.88 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  29.55 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  28.29 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  25.52 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  32.18 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  26.85 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  26.84 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  24.2 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  21 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  34.25 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  34.72 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  27.75 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  24.88 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
259 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  38.16 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  40.28 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  33.33 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  26.27 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  35.56 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  31.08 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  34.72 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  30.68 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  25.77 
 
 
462 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  27.75 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  32.43 
 
 
264 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  28.37 
 
 
260 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>