47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0161 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  78.74 
 
 		 174 aa  289  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  65.66 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  63.69 
 
 		 171 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  61.4 
 
 		 171 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  62.2 
 
 		 166 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  60.51 
 
 		 171 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  48.28 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  44.65 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  42.14 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  37.72 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.94 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  42.77 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  43.4 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  43.4 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  38.99 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  41.83 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  36.48 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  36.48 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  38.16 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  35.85 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  39.22 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  29.3 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  26.62 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  25.5 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  26.57 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  26.97 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  24.14 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  25.34 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  23.31 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  25.16 
 
 		 176 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  25.47 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  25.47 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  25.47 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  25.47 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  25.5 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  26.83 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  26.09 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>