More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4120 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  62.61 
 
 
640 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
568 aa  1162    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.73 
 
 
568 aa  588  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  44.85 
 
 
550 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  38.69 
 
 
547 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.52 
 
 
549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  38.5 
 
 
550 aa  356  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  38.77 
 
 
548 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  38.57 
 
 
553 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  37.84 
 
 
559 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  36.15 
 
 
540 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.33 
 
 
557 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  35.79 
 
 
540 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  34.57 
 
 
847 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  35.21 
 
 
847 aa  329  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.05 
 
 
574 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  37.08 
 
 
551 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.94 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1073  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.9 
 
 
586 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0677257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1015  thiamine pyrophosphate enzyme  34.01 
 
 
586 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.22 
 
 
586 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2104  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.72 
 
 
588 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  33.69 
 
 
582 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2478  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  31.22 
 
 
585 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  32.25 
 
 
586 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  33.33 
 
 
579 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.32 
 
 
588 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 
554 aa  257  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.49 
 
 
581 aa  253  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.27 
 
 
566 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.62 
 
 
587 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.97 
 
 
581 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  29.6 
 
 
587 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  32.38 
 
 
570 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  29.22 
 
 
587 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7490  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
591 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300695  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 
563 aa  246  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.7 
 
 
587 aa  246  8e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.39 
 
 
599 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.91 
 
 
588 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.3 
 
 
573 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.73 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.73 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
582 aa  241  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
572 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.97 
 
 
576 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 
572 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
564 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
561 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.5 
 
 
574 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.13 
 
 
566 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.18 
 
 
564 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.12 
 
 
552 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.31 
 
 
574 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.52 
 
 
579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  28.49 
 
 
566 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.85 
 
 
593 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.62 
 
 
567 aa  236  7e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
542 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.15 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  30.07 
 
 
569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.42 
 
 
572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.05 
 
 
563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.26 
 
 
558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 
562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.96 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  29.93 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.04 
 
 
552 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.05 
 
 
574 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.88 
 
 
574 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 
574 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 
572 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 
572 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.05 
 
 
585 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.67 
 
 
572 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.67 
 
 
572 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.95 
 
 
566 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
581 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.67 
 
 
572 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 
574 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 
585 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 
588 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
559 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 
572 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.42 
 
 
620 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.36 
 
 
601 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 
585 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
581 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.49 
 
 
574 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
608 aa  231  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.42 
 
 
572 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 
584 aa  230  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 
535 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.76 
 
 
573 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 
558 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.13 
 
 
594 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.93 
 
 
566 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>